Интерфейс E1 запускается при первом обращении к нему, или при первой необходимости. Т.е. в вашем случае, до вызова "sconfig ce1 iface=1..." второй E1 выключен.

Чтобы оба интерфейса работали сразу задайте им конфигурацию, т.е.:
tau32_0_e1_1="unframed=off crc4=... cas=... higain=..."