Желательно конечно сперва настроить канал, а затем поднять интерфейс, чтоб меньше битых пакетов выдавалось. Но это обычно, не принципиально.
В rc.conf-е можно указать параметры интерфейса как обычно, а sconfig вызвать, например, из rc.local. Это то что приходит на вскидку и подойти должно для любой версии FreeBSD.
А так нужно смотреть что будет удобнее в конкретном случае.