Надо будет еще потестировать посмотреть что как и где. Завышеное mtu было для повышение надежности на слабых системах. Возможно стоит более детально изучить это вопрос чтоб дать возможность более свободного тюнинга.
Если сделать систему бездисковой, и уменьшить очереди, то должно стать гараздо лучше.
В любом случае спасибо за исследование.