Приёмо-передатчик работает независимо от кросс-коннектора. По TDM-шине какие-нибудь данные передаются всегда.

Если Вы "на ходу" переключите отдельные канальные интервалы, то в сторону приёмо-передатчика пойдет "мусор" (скорее всего либо нули, либо единицы, зависит от ревизии микросхем и внутренней "прошивки").

То, что будет идти в сторону приёмо-передатчика в момент заполнения данными запроса на приём, то он (приёмо-передатчик) аккуратно примет из канальных интервалов и разместит в байтах памяти.

О параметрах SetCrossMatrix() и заполнении матрицы кросс-коммутации всё написано документации по DDK для Tau32-PCI http://www.cronyx.ru/hardware/pdf/tau32-ddk.pdf